Spark GraphX图构造者

2018-11-26 16:36 更新

Spark GraphX图构造者

GraphX提供了几种方式从RDD或者磁盘上的顶点和边集合构造图。默认情况下,没有哪个图构造者为图的边重新分区,而是把边保留在默认的分区中(例如HDFS中它们的原始块)。Graph.groupEdges:Graph[VD,ED])需要重新分区图,因为它假定相同的边将会被分配到同一个分区,所以你必须在调用groupEdges之前调用Graph.partitionBy

object GraphLoader {
  def edgeListFile(
      sc: SparkContext,
      path: String,
      canonicalOrientation: Boolean = false,
      minEdgePartitions: Int = 1)
    : Graph[Int, Int]
}

GraphLoader.edgeListFile提供了一个方式从磁盘上的边列表中加载一个图。它解析如下形式(源顶点ID,目标顶点ID)的连接表,跳过以#开头的注释行。

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它从指定的边创建一个图,自动地创建边提及的所有顶点。所有的顶点和边的属性默认都是1。canonicalOrientation参数允许重定向正方向(srcId < dstId)的边。这在connected components算法中需要用到。minEdgePartitions参数指定生成的边分区的最少数量。边分区可能比指定的分区更多,例如,一个HDFS文件包含更多的块。

object Graph {
  def apply[VD, ED](
      vertices: RDD[(VertexId, VD)],
      edges: RDD[Edge[ED]],
      defaultVertexAttr: VD = null)
    : Graph[VD, ED]
  def fromEdges[VD, ED](
      edges: RDD[Edge[ED]],
      defaultValue: VD): Graph[VD, ED]
  def fromEdgeTuples[VD](
      rawEdges: RDD[(VertexId, VertexId)],
      defaultValue: VD,
      uniqueEdges: Option[PartitionStrategy] = None): Graph[VD, Int]
}

Graph.apply(ClassTag[VD],ClassTag[ED]):Graph[VD,ED])允许从顶点和边的RDD上创建一个图。重复的顶点可以任意的选择其中一个,在边RDD中而不是在顶点RDD中发现的顶点分配默认的属性。

Graph.fromEdges允许仅仅从一个边RDD上创建一个图,它自动地创建边提及的顶点,并分配这些顶点默认的值。

Graph.fromEdgeTuples(ClassTag[VD]):Graph[VD,Int])允许仅仅从一个边元组组成的RDD上创建一个图。分配给边的值为1。它自动地创建边提及的顶点,并分配这些顶点默认的值。它还支持删除边。为了删除边,需要传递一个PartitionStrategy为值的Some作为uniqueEdges参数(如uniqueEdges = Some(PartitionStrategy.RandomVertexCut))。分配相同的边到同一个分区从而使它们可以被删除,一个分区策略是必须的。

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